Oulà, das riecht nach Micro-SD-Korruption!
Wie lange hast du deine Micro-SD schon?
Falls möglich, empfehle ich dir dringend, auf eine SSD statt auf eine Micro-SD umzusteigen:
das wird die Leistung und die allgemeine Stabilität deiner Instanz deutlich verbessern.
Da es jetzt schon Super-SSDs ab 17€ gibt, wäre es schade, darauf zu verzichten 