Hola @jcmoriaud y bienvenido al universo de Gladys.
Para tu pregunta 1, no podré ayudarte porque no tengo dispositivos Tuya.
Sin embargo, me interesaría tu feedback dentro de un mes (o menos) para saber si debes reactivar las API de Tuya o no en la cuenta de desarrollo de Tuya. @Fabrice tuvo problemas (ver su publicación )
Para la pregunta 2, no basta con tener una clave Thread, también hay que tener un servicio Open Thread Border Router, lo cual aún no es el caso en Gladys.
Hay un largo post sobre este tema.
¿Podrías hacer una captura de pantalla de la configuración en la integración zigbee2mqtt? (elección del puerto USB y del dongle)